Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT17Q04695 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms