Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4A11Q02928 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4A11Q02928 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms