Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NHLH2Q02577 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms