Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSC2Q02487 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSC2Q02487 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms