Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APBA1Q02410 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APBA1Q02410 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APBA1Q02410 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms