Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF17Q02223 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms