Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC6A3Q01959 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms