Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTUD4Q01804 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUD4Q01804 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms