Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK17Q00537 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK17Q00537 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms