Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDKL1Q00532 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDKL1Q00532 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms