Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLDN10P78369 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN10P78369 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms