Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL11P62913 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL11P62913 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL11P62913 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL11P62913 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL11P62913 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL11P62913 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL11P62913 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL11P62913 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL11P62913 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL11P62913 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL11P62913 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL11P62913 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL11P62913 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL11P62913 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL11P62913 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL11P62913 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL11P62913 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL11P62913 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL11P62913 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL11P62913 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL11P62913 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL11P62913 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL11P62913 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL11P62913 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL11P62913 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL11P62913 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPL11P62913 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPL11P62913 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL11P62913 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL11P62913 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL11P62913 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL11P62913 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL11P62913 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL11P62913 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL11P62913 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL11P62913 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL11P62913 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL11P62913 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL11P62913 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL11P62913 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL11P62913 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL11P62913 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL11P62913 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL11P62913 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL11P62913 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL11P62913 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL11P62913 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL11P62913 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL11P62913 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL11P62913 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL11P62913 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL11P62913 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL11P62913 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL11P62913 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL11P62913 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPL11P62913 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL11P62913 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL11P62913 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL11P62913 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL11P62913 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL11P62913 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL11P62913 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL11P62913 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL11P62913 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPL11P62913 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms