Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2LP62875 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2LP62875 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms