Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS3AP61247 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS3AP61247 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms