Protein–RNA interactions for Protein: P60022

DEFB1, Beta-defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB1P60022 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEFB1P60022 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFB1P60022 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFB1P60022 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFB1P60022 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFB1P60022 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFB1P60022 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFB1P60022 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFB1P60022 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFB1P60022 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFB1P60022 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFB1P60022 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFB1P60022 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFB1P60022 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFB1P60022 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFB1P60022 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFB1P60022 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFB1P60022 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFB1P60022 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFB1P60022 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFB1P60022 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DEFB1P60022 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms