Protein–RNA interactions for Protein: P56696

KCNQ4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ4P56696 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNQ4P56696 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNQ4P56696 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms