Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX10P56693 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX10P56693 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX10P56693 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX10P56693 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX10P56693 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX10P56693 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX10P56693 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX10P56693 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX10P56693 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX10P56693 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX10P56693 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX10P56693 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX10P56693 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX10P56693 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX10P56693 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX10P56693 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX10P56693 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX10P56693 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX10P56693 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX10P56693 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX10P56693 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX10P56693 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX10P56693 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX10P56693 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX10P56693 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX10P56693 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX10P56693 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX10P56693 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX10P56693 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX10P56693 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX10P56693 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX10P56693 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX10P56693 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX10P56693 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX10P56693 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX10P56693 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX10P56693 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX10P56693 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX10P56693 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX10P56693 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX10P56693 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX10P56693 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX10P56693 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX10P56693 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX10P56693 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX10P56693 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX10P56693 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX10P56693 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX10P56693 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX10P56693 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX10P56693 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX10P56693 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX10P56693 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX10P56693 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX10P56693 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX10P56693 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX10P56693 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX10P56693 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX10P56693 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX10P56693 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX10P56693 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX10P56693 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX10P56693 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX10P56693 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX10P56693 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX10P56693 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX10P56693 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX10P56693 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX10P56693 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX10P56693 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX10P56693 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX10P56693 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX10P56693 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX10P56693 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX10P56693 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX10P56693 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX10P56693 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX10P56693 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX10P56693 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX10P56693 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX10P56693 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX10P56693 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX10P56693 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX10P56693 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX10P56693 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX10P56693 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX10P56693 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX10P56693 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX10P56693 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX10P56693 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX10P56693 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX10P56693 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX10P56693 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX10P56693 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX10P56693 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX10P56693 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX10P56693 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX10P56693 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX10P56693 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms