Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RAD23BP54727 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD23BP54727 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD23BP54727 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms