Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS2P54278 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS2P54278 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS2P54278 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS2P54278 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS2P54278 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS2P54278 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS2P54278 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS2P54278 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS2P54278 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS2P54278 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS2P54278 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS2P54278 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS2P54278 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS2P54278 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS2P54278 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS2P54278 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS2P54278 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS2P54278 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS2P54278 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS2P54278 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS2P54278 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS2P54278 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMS2P54278 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS2P54278 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS2P54278 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS2P54278 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS2P54278 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS2P54278 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS2P54278 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS2P54278 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS2P54278 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS2P54278 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS2P54278 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS2P54278 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS2P54278 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMS2P54278 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS2P54278 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS2P54278 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS2P54278 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS2P54278 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS2P54278 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS2P54278 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS2P54278 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS2P54278 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS2P54278 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS2P54278 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMS2P54278 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PMS2P54278 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PMS2P54278 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PMS2P54278 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PMS2P54278 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PMS2P54278 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PMS2P54278 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PMS2P54278 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PMS2P54278 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PMS2P54278 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P54278 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P54278 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P54278 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P54278 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P54278 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P54278 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P54278 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P54278 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P54278 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P54278 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P54278 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P54278 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P54278 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P54278 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P54278 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P54278 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P54278 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMS2P54278 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS2P54278 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS2P54278 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS2P54278 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS2P54278 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS2P54278 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS2P54278 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS2P54278 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS2P54278 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS2P54278 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS2P54278 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS2P54278 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS2P54278 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS2P54278 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS2P54278 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS2P54278 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS2P54278 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMS2P54278 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS2P54278 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS2P54278 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS2P54278 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS2P54278 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS2P54278 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS2P54278 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS2P54278 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMS2P54278 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms