Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PGGT1BP53609 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PGGT1BP53609 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PGGT1BP53609 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PGGT1BP53609 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PGGT1BP53609 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGGT1BP53609 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PGGT1BP53609 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PGGT1BP53609 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PGGT1BP53609 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PGGT1BP53609 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGGT1BP53609 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PGGT1BP53609 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PGGT1BP53609 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGGT1BP53609 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGGT1BP53609 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGGT1BP53609 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PGGT1BP53609 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGGT1BP53609 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGGT1BP53609 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PGGT1BP53609 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PGGT1BP53609 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGGT1BP53609 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PGGT1BP53609 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PGGT1BP53609 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PGGT1BP53609 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PGGT1BP53609 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PGGT1BP53609 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PGGT1BP53609 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGGT1BP53609 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGGT1BP53609 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGGT1BP53609 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PGGT1BP53609 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGGT1BP53609 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PGGT1BP53609 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGGT1BP53609 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGGT1BP53609 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PGGT1BP53609 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGGT1BP53609 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGGT1BP53609 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PGGT1BP53609 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PGGT1BP53609 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PGGT1BP53609 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PGGT1BP53609 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGGT1BP53609 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGGT1BP53609 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PGGT1BP53609 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGGT1BP53609 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGGT1BP53609 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PGGT1BP53609 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PGGT1BP53609 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PGGT1BP53609 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGGT1BP53609 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGGT1BP53609 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PGGT1BP53609 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGGT1BP53609 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGGT1BP53609 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PGGT1BP53609 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PGGT1BP53609 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PGGT1BP53609 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGGT1BP53609 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PGGT1BP53609 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PGGT1BP53609 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PGGT1BP53609 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PGGT1BP53609 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PGGT1BP53609 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGGT1BP53609 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGGT1BP53609 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PGGT1BP53609 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGGT1BP53609 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGGT1BP53609 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PGGT1BP53609 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PGGT1BP53609 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PGGT1BP53609 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PGGT1BP53609 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PGGT1BP53609 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PGGT1BP53609 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PGGT1BP53609 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGGT1BP53609 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGGT1BP53609 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGGT1BP53609 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGGT1BP53609 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGGT1BP53609 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGGT1BP53609 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGGT1BP53609 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGGT1BP53609 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PGGT1BP53609 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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