Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPT1P50897 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPT1P50897 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPT1P50897 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPT1P50897 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPT1P50897 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPT1P50897 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPT1P50897 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PPT1P50897 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPT1P50897 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPT1P50897 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPT1P50897 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPT1P50897 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPT1P50897 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPT1P50897 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPT1P50897 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPT1P50897 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPT1P50897 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPT1P50897 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPT1P50897 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PPT1P50897 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPT1P50897 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPT1P50897 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPT1P50897 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPT1P50897 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPT1P50897 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPT1P50897 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPT1P50897 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPT1P50897 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPT1P50897 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPT1P50897 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPT1P50897 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPT1P50897 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPT1P50897 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPT1P50897 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPT1P50897 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPT1P50897 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPT1P50897 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPT1P50897 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPT1P50897 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPT1P50897 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPT1P50897 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPT1P50897 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPT1P50897 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPT1P50897 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPT1P50897 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPT1P50897 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPT1P50897 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PPT1P50897 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPT1P50897 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPT1P50897 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPT1P50897 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPT1P50897 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPT1P50897 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPT1P50897 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPT1P50897 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPT1P50897 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPT1P50897 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPT1P50897 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPT1P50897 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPT1P50897 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPT1P50897 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPT1P50897 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPT1P50897 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPT1P50897 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPT1P50897 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPT1P50897 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPT1P50897 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPT1P50897 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPT1P50897 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPT1P50897 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPT1P50897 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPT1P50897 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPT1P50897 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPT1P50897 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPT1P50897 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PPT1P50897 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPT1P50897 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPT1P50897 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPT1P50897 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPT1P50897 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPT1P50897 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPT1P50897 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPT1P50897 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPT1P50897 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPT1P50897 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPT1P50897 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPT1P50897 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPT1P50897 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPT1P50897 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPT1P50897 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPT1P50897 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PPT1P50897 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPT1P50897 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPT1P50897 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPT1P50897 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPT1P50897 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPT1P50897 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPT1P50897 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PPT1P50897 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms