Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK1EP49674 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK1EP49674 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK1EP49674 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK1EP49674 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK1EP49674 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK1EP49674 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK1EP49674 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK1EP49674 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK1EP49674 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK1EP49674 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK1EP49674 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK1EP49674 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK1EP49674 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK1EP49674 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CSNK1EP49674 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSNK1EP49674 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSNK1EP49674 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSNK1EP49674 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSNK1EP49674 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CSNK1EP49674 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSNK1EP49674 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms