Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NRIP1P48552 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRIP1P48552 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms