Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GJA8P48165 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJA8P48165 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJA8P48165 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJA8P48165 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJA8P48165 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJA8P48165 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA8P48165 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA8P48165 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA8P48165 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA8P48165 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA8P48165 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA8P48165 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA8P48165 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GJA8P48165 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GJA8P48165 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA8P48165 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA8P48165 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA8P48165 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA8P48165 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA8P48165 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA8P48165 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA8P48165 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA8P48165 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA8P48165 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA8P48165 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA8P48165 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA8P48165 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA8P48165 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA8P48165 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA8P48165 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA8P48165 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA8P48165 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA8P48165 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA8P48165 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA8P48165 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA8P48165 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA8P48165 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA8P48165 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA8P48165 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA8P48165 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA8P48165 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA8P48165 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA8P48165 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA8P48165 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA8P48165 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA8P48165 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA8P48165 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA8P48165 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA8P48165 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA8P48165 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA8P48165 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA8P48165 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA8P48165 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA8P48165 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA8P48165 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA8P48165 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA8P48165 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA8P48165 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA8P48165 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA8P48165 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA8P48165 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA8P48165 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA8P48165 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA8P48165 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA8P48165 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA8P48165 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA8P48165 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA8P48165 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA8P48165 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA8P48165 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA8P48165 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA8P48165 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA8P48165 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA8P48165 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA8P48165 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA8P48165 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA8P48165 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA8P48165 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA8P48165 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA8P48165 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA8P48165 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA8P48165 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA8P48165 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA8P48165 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA8P48165 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA8P48165 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA8P48165 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA8P48165 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA8P48165 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA8P48165 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA8P48165 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA8P48165 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA8P48165 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA8P48165 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA8P48165 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA8P48165 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA8P48165 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA8P48165 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA8P48165 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms