Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
CDKN1BP46527 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDKN1BP46527 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms