Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP5P45974 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP5P45974 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP5P45974 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
USP5P45974 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP5P45974 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP5P45974 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP5P45974 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP5P45974 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP5P45974 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP5P45974 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
USP5P45974 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP5P45974 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP5P45974 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP5P45974 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP5P45974 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP5P45974 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP5P45974 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP5P45974 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP5P45974 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP5P45974 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP5P45974 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP5P45974 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP5P45974 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP5P45974 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP5P45974 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP5P45974 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP5P45974 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP5P45974 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP5P45974 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP5P45974 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP5P45974 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP5P45974 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP5P45974 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP5P45974 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP5P45974 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
USP5P45974 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP5P45974 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
USP5P45974 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP5P45974 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP5P45974 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP5P45974 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP5P45974 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP5P45974 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP5P45974 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP5P45974 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP5P45974 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP5P45974 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP5P45974 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP5P45974 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP5P45974 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP5P45974 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP5P45974 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP5P45974 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP5P45974 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP5P45974 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
USP5P45974 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP5P45974 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP5P45974 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP5P45974 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP5P45974 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP5P45974 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP5P45974 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP5P45974 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP5P45974 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP5P45974 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP5P45974 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP5P45974 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP5P45974 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP5P45974 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP5P45974 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP5P45974 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP5P45974 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP5P45974 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP5P45974 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP5P45974 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP5P45974 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP5P45974 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP5P45974 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP5P45974 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP5P45974 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP5P45974 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP5P45974 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP5P45974 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP5P45974 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP5P45974 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP5P45974 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP5P45974 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP5P45974 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP5P45974 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP5P45974 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP5P45974 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP5P45974 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP5P45974 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP5P45974 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
USP5P45974 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP5P45974 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP5P45974 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
USP5P45974 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP5P45974 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms