Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNNT2P45379 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNNT2P45379 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms