Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCAMP43121 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCAMP43121 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCAMP43121 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MCAMP43121 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
MCAMP43121 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCAMP43121 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCAMP43121 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCAMP43121 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCAMP43121 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCAMP43121 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCAMP43121 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCAMP43121 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCAMP43121 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCAMP43121 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCAMP43121 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCAMP43121 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCAMP43121 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MCAMP43121 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCAMP43121 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCAMP43121 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCAMP43121 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCAMP43121 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MCAMP43121 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCAMP43121 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCAMP43121 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCAMP43121 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCAMP43121 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCAMP43121 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCAMP43121 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCAMP43121 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCAMP43121 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCAMP43121 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCAMP43121 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCAMP43121 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCAMP43121 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCAMP43121 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCAMP43121 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCAMP43121 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCAMP43121 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCAMP43121 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCAMP43121 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCAMP43121 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCAMP43121 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCAMP43121 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCAMP43121 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCAMP43121 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCAMP43121 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCAMP43121 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCAMP43121 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCAMP43121 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCAMP43121 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCAMP43121 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCAMP43121 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCAMP43121 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCAMP43121 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCAMP43121 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MCAMP43121 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCAMP43121 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCAMP43121 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCAMP43121 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCAMP43121 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MCAMP43121 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCAMP43121 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCAMP43121 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCAMP43121 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCAMP43121 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCAMP43121 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCAMP43121 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCAMP43121 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCAMP43121 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCAMP43121 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MCAMP43121 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MCAMP43121 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCAMP43121 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCAMP43121 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCAMP43121 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCAMP43121 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCAMP43121 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCAMP43121 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCAMP43121 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCAMP43121 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCAMP43121 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCAMP43121 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCAMP43121 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCAMP43121 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCAMP43121 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCAMP43121 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCAMP43121 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCAMP43121 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCAMP43121 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCAMP43121 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCAMP43121 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCAMP43121 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCAMP43121 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCAMP43121 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCAMP43121 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCAMP43121 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCAMP43121 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCAMP43121 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms