Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMPOP42166 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMPOP42166 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TMPOP42166 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMPOP42166 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMPOP42166 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMPOP42166 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TMPOP42166 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMPOP42166 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMPOP42166 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMPOP42166 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMPOP42166 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMPOP42166 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMPOP42166 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMPOP42166 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMPOP42166 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMPOP42166 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMPOP42166 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMPOP42166 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMPOP42166 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMPOP42166 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMPOP42166 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMPOP42166 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMPOP42166 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMPOP42166 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMPOP42166 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMPOP42166 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMPOP42166 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMPOP42166 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMPOP42166 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMPOP42166 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TMPOP42166 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMPOP42166 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMPOP42166 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMPOP42166 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMPOP42166 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TMPOP42166 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMPOP42166 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMPOP42166 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMPOP42166 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMPOP42166 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMPOP42166 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMPOP42166 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMPOP42166 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMPOP42166 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
TMPOP42166 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMPOP42166 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMPOP42166 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMPOP42166 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMPOP42166 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMPOP42166 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMPOP42166 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TMPOP42166 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMPOP42166 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMPOP42166 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMPOP42166 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMPOP42166 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMPOP42166 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMPOP42166 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMPOP42166 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMPOP42166 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMPOP42166 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMPOP42166 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMPOP42166 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMPOP42166 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMPOP42166 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMPOP42166 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMPOP42166 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMPOP42166 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMPOP42166 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMPOP42166 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMPOP42166 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMPOP42166 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMPOP42166 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMPOP42166 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMPOP42166 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMPOP42166 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMPOP42166 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMPOP42166 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMPOP42166 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMPOP42166 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMPOP42166 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMPOP42166 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMPOP42166 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMPOP42166 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TMPOP42166 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMPOP42166 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMPOP42166 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMPOP42166 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMPOP42166 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMPOP42166 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMPOP42166 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMPOP42166 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMPOP42166 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TMPOP42166 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMPOP42166 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMPOP42166 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMPOP42166 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMPOP42166 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMPOP42166 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms