Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIK1P39086 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK1P39086 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms