Protein–RNA interactions for Protein: P38996

NAB3, Nuclear polyadenylated RNA-binding protein 3, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 802 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NAB3	P38996	SEM1	YDR363W-A	270 nt		4.09	□□□□□ -1.75
NAB3	P38996	ECM11	YDR446W	909 nt		4.09	□□□□□ -1.75
NAB3	P38996	THO1	YER063W	657 nt		4.09	□□□□□ -1.75
NAB3	P38996	VFA1	YER128W	612 nt		4.09	□□□□□ -1.75
NAB3	P38996	YGR161W-C	YGR161W-C	279 nt		4.09	□□□□□ -1.75
NAB3	P38996	PAU13	YHL046C	363 nt		4.09	□□□□□ -1.75
NAB3	P38996	YHR112C	YHR112C	1137 nt		4.09	□□□□□ -1.75
NAB3	P38996	VMA5	YKL080W	1179 nt		4.09	□□□□□ -1.75
NAB3	P38996	RSM19	YNR037C	276 nt		4.09	□□□□□ -1.75
NAB3	P38996	MGR2	YPL098C	342 nt		4.09	□□□□□ -1.75
NAB3	P38996	UMP1	YBR173C	447 nt		4.09	□□□□□ -1.75
NAB3	P38996	IOC3	YFR013W	2364 nt		4.09	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	SDP1	YIL113W	630 nt		4.08	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	YKL156C-A	YKL156C-A	117 nt		4.08	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	ATG33	YLR356W	594 nt		4.08	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	VPS9	YML097C	1356 nt		4.08	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	LCB4	YOR171C	1875 nt		4.08	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	CHS3	YBR023C	3498 nt		4.08	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	SEA4	YBL104C	3117 nt		4.08	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	PAH1	YMR165C	2589 nt		4.08	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	YCR023C	YCR023C	1836 nt		4.07	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	GAD1	YMR250W	1758 nt		4.07	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	KRI1	YNL308C	1776 nt		4.07	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	PEX1	YKL197C	3132 nt		4.07	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	OTU1	YFL044C	906 nt		4.07	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	BCD1	YHR040W	1101 nt		4.07	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	PFS1	YHR185C	714 nt		4.07	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	CAP2	YIL034C	864 nt		4.07	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	YIR040C	YIR040C	333 nt		4.07	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	COA3	YJL062W-A	258 nt		4.07	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	MCT1	YOR221C	1083 nt		4.07	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	POL30	YBR088C	777 nt		4.07	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	YDL176W	YDL176W	2127 nt		4.07	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	ENA5	YDR038C	3276 nt		4.06	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	ENA2	YDR039C	3276 nt		4.06	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	ENA1	YDR040C	3276 nt		4.06	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	RTC1	YOL138C	4026 nt		4.06	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	YCF1	YDR135C	4548 nt		4.06	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	RNT1	YMR239C	1416 nt		4.06	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	WHI3	YNL197C	1986 nt		4.06	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	YCR075W-A	YCR075W-A	228 nt		4.06	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	YDR464C-A	YDR464C-A	189 nt		4.06	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	YEL075C	YEL075C	369 nt		4.06	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	YGR039W	YGR039W	312 nt		4.06	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	LSO1	YJR005C-A	282 nt		4.06	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	YNL184C	YNL184C	327 nt		4.06	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	ICS2	YBR157C	768 nt		4.06	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	REG1	YDR028C	3045 nt		4.06	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	CDC40	YDR364C	1368 nt		4.05	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	YGR051C	YGR051C	324 nt		4.05	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	tS(AGA)D3	tS(AGA)D3	83 nt		4.05	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	MDV1	YJL112W	2145 nt		4.05	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	SSN8	YNL025C	972 nt		4.05	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	YOR062C	YOR062C	807 nt		4.05	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	PLP2	YOR281C	861 nt		4.05	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	YPL025C	YPL025C	558 nt		4.05	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	ERV15	YBR210W	429 nt		4.05	□□□□□ -1.76	RIP-Chip
NAB3	P38996	ZPR1	YGR211W	1461 nt		4.05	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	YDR131C	YDR131C	1671 nt		4.04	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	YJR012C	YJR012C	624 nt		4.04	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	YKR011C	YKR011C	1062 nt		4.04	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	YMR105W-A	YMR105W-A	195 nt		4.04	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	TIF34	YMR146C	1044 nt		4.04	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	PNO1	YOR145C	825 nt		4.04	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	SAS5	YOR213C	747 nt		4.04	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	RRP14	YKL082C	1305 nt		4.03	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	KIN3	YAR018C	1308 nt		4.03	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	SUP45	YBR143C	1314 nt		4.03	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	AIM11	YER093C-A	414 nt		4.03	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	AAR2	YBL074C	1068 nt		4.03	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	RPN8	YOR261C	1017 nt		4.03	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	APD1	YBR151W	951 nt		4.03	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	NOP58	YOR310C	1536 nt		4.03	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	EMP70	YLR083C	2004 nt		4.03	□□□□□ -1.76
NAB3	P38996	ARG5,6	YER069W	2592 nt		4.03	□□□□□ -1.77
NAB3	P38996	YER076C	YER076C	909 nt		4.02	□□□□□ -1.77
NAB3	P38996	SPR6	YER115C	576 nt		4.02	□□□□□ -1.77
NAB3	P38996	YGR073C	YGR073C	372 nt		4.02	□□□□□ -1.77
NAB3	P38996	MMF1	YIL051C	438 nt		4.02	□□□□□ -1.77
NAB3	P38996	SKG1	YKR100C	1068 nt		4.02	□□□□□ -1.77
NAB3	P38996	YLR163W-A	YLR163W-A	114 nt		4.02	□□□□□ -1.77
NAB3	P38996	HMX1	YLR205C	954 nt		4.02	□□□□□ -1.77
NAB3	P38996	GSP1	YLR293C	660 nt		4.02	□□□□□ -1.77
NAB3	P38996	ATG29	YPL166W	642 nt		4.02	□□□□□ -1.77
NAB3	P38996	CSH1	YBR161W	1131 nt		4.02	□□□□□ -1.77	RIP-Chip
NAB3	P38996	FLO9	YAL063C	3969 nt		4.02	□□□□□ -1.77
NAB3	P38996	MSH2	YOL090W	2895 nt		4.02	□□□□□ -1.77
NAB3	P38996	HO	YDL227C	1761 nt		4.02	□□□□□ -1.77
NAB3	P38996	ATG21	YPL100W	1491 nt		4.01	□□□□□ -1.77
NAB3	P38996	MYO5	YMR109W	3660 nt		4.01	□□□□□ -1.77
NAB3	P38996	PET100	YDR079W	336 nt		4.01	□□□□□ -1.77
NAB3	P38996	MPS2	YGL075C	1164 nt		4.01	□□□□□ -1.77
NAB3	P38996	MPC1	YGL080W	393 nt		4.01	□□□□□ -1.77
NAB3	P38996	BRR6	YGL247W	594 nt		4.01	□□□□□ -1.77
NAB3	P38996	SPT4	YGR063C	309 nt		4.01	□□□□□ -1.77
NAB3	P38996	YHL026C	YHL026C	948 nt		4.01	□□□□□ -1.77
NAB3	P38996	RPB3	YIL021W	957 nt		4.01	□□□□□ -1.77
NAB3	P38996	YIL165C	YIL165C	360 nt		4.01	□□□□□ -1.77
NAB3	P38996	FBP1	YLR377C	1047 nt		4.01	□□□□□ -1.77
NAB3	P38996	PML39	YML107C	1005 nt		4.01	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.3 ms