Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCN1P35523 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCN1P35523 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCN1P35523 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCN1P35523 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCN1P35523 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCN1P35523 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCN1P35523 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCN1P35523 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CLCN1P35523 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLCN1P35523 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLCN1P35523 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLCN1P35523 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN1P35523 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN1P35523 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms