Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDXP35241 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDXP35241 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RDXP35241 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDXP35241 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDXP35241 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDXP35241 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDXP35241 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDXP35241 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RDXP35241 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RDXP35241 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDXP35241 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDXP35241 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDXP35241 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDXP35241 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDXP35241 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDXP35241 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDXP35241 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDXP35241 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDXP35241 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDXP35241 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RDXP35241 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDXP35241 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDXP35241 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDXP35241 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDXP35241 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDXP35241 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDXP35241 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDXP35241 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDXP35241 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RDXP35241 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RDXP35241 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RDXP35241 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RDXP35241 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RDXP35241 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RDXP35241 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RDXP35241 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RDXP35241 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RDXP35241 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDXP35241 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDXP35241 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDXP35241 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDXP35241 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDXP35241 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDXP35241 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDXP35241 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDXP35241 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDXP35241 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDXP35241 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDXP35241 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RDXP35241 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDXP35241 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDXP35241 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDXP35241 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDXP35241 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDXP35241 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDXP35241 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDXP35241 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDXP35241 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDXP35241 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDXP35241 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDXP35241 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDXP35241 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDXP35241 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDXP35241 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDXP35241 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDXP35241 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDXP35241 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDXP35241 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDXP35241 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDXP35241 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDXP35241 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDXP35241 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDXP35241 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDXP35241 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDXP35241 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDXP35241 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDXP35241 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDXP35241 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDXP35241 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDXP35241 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDXP35241 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDXP35241 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RDXP35241 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDXP35241 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDXP35241 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDXP35241 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDXP35241 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDXP35241 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDXP35241 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDXP35241 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDXP35241 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDXP35241 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDXP35241 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RDXP35241 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDXP35241 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RDXP35241 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDXP35241 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDXP35241 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDXP35241 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms