Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC1P35052 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC1P35052 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC1P35052 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC1P35052 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC1P35052 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC1P35052 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC1P35052 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC1P35052 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC1P35052 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC1P35052 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC1P35052 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPC1P35052 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPC1P35052 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPC1P35052 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GPC1P35052 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPC1P35052 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPC1P35052 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPC1P35052 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPC1P35052 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPC1P35052 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPC1P35052 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPC1P35052 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPC1P35052 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPC1P35052 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPC1P35052 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPC1P35052 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPC1P35052 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPC1P35052 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPC1P35052 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GPC1P35052 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPC1P35052 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPC1P35052 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPC1P35052 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPC1P35052 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPC1P35052 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPC1P35052 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPC1P35052 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPC1P35052 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPC1P35052 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPC1P35052 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPC1P35052 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPC1P35052 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GPC1P35052 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPC1P35052 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPC1P35052 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPC1P35052 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPC1P35052 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPC1P35052 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPC1P35052 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GPC1P35052 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPC1P35052 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPC1P35052 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPC1P35052 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPC1P35052 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GPC1P35052 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPC1P35052 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPC1P35052 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GPC1P35052 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPC1P35052 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPC1P35052 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPC1P35052 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPC1P35052 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPC1P35052 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPC1P35052 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPC1P35052 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPC1P35052 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPC1P35052 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GPC1P35052 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPC1P35052 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPC1P35052 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPC1P35052 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPC1P35052 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPC1P35052 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPC1P35052 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPC1P35052 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPC1P35052 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GPC1P35052 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPC1P35052 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPC1P35052 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPC1P35052 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPC1P35052 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPC1P35052 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPC1P35052 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPC1P35052 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPC1P35052 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPC1P35052 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPC1P35052 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GPC1P35052 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GPC1P35052 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPC1P35052 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPC1P35052 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPC1P35052 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPC1P35052 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPC1P35052 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPC1P35052 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPC1P35052 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GPC1P35052 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GPC1P35052 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GPC1P35052 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms