Protein–RNA interactions for Protein: P32842

VMA11, V-type proton ATPase subunit c', yeast

Predictions only

Length 164 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA11	P32842	MEF1	YLR069C	2286 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	PHO5	YBR093C	1404 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	MIG1	YGL035C	1515 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	DTD1	YDL219W	453 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	GRX3	YDR098C	858 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	tF(GAA)D	tF(GAA)D	73 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	tF(GAA)N	tF(GAA)N	73 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	YHR180W	YHR180W	492 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	PET130	YJL023C	1044 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	YBR096W	YBR096W	693 nt		2.69	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	YPR022C	YPR022C	3402 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	SPO71	YDR104C	3738 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	NUP60	YAR002W	1620 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	RPN1	YHR027C	2982 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	FRQ1	YDR373W	573 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	WBP1	YEL002C	1293 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	TOS8	YGL096W	831 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	BCD1	YHR040W	1101 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	COX23	YHR116W	456 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	YJR111C	YJR111C	852 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	YLR444C	YLR444C	303 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	OCA2	YNL056W	594 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	RRG9	YNL213C	645 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	YNL320W	YNL320W	855 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	RFM1	YOR279C	933 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	UAF30	YOR295W	687 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	YOR338W	YOR338W	1092 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	MRPL37	YBR268W	318 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	GPI1	YGR216C	1830 nt		2.68	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	URA2	YJL130C	6645 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	ISM1	YPL040C	3009 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	SHU2	YDR078C	672 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	YHP1	YDR451C	1062 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	LST7	YGR057C	729 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	HRT3	YLR097C	1035 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	TPM1	YNL079C	600 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	IZH2	YOL002C	954 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	NIP7	YPL211W	546 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	YPR108W-A	YPR108W-A	213 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	snR42	snR42	351 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	YBR242W	YBR242W	717 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	SET1	YHR119W	3243 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	YFL040W	YFL040W	1623 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	CAF130	YGR134W	3369 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	PST1	YDR055W	1335 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	TOP1	YOL006C	2310 nt		2.67	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	SMC3	YJL074C	3693 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	IMH1	YLR309C	2736 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	GYP6	YJL044C	1377 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	TRM1	YDR120C	1713 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	SCL1	YGL011C	759 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	LIF1	YGL090W	1266 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	ERP1	YAR002C-A	660 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	APC9	YLR102C	798 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	UNG1	YML021C	1080 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	MRPS17	YMR188C	714 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	CYC2	YOR037W	1101 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	USV1	YPL230W	1176 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	TIM12	YBR091C	330 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	SKN7	YHR206W	1869 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	TPD3	YAL016W	1908 nt		2.66	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	YKR015C	YKR015C	1707 nt		2.65	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	CLG1	YGL215W	1359 nt		2.65	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	YDL242W	YDL242W	354 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	YGR017W	YGR017W	894 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	SDO1	YLR022C	753 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	BUR2	YLR226W	1188 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	SHH3	YMR118C	591 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	GOT1	YMR292W	417 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	YBL081W	YBL081W	1107 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	YOR082C	YOR082C	342 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	DIB1	YPR082C	432 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	GIS4	YML006C	2325 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	XRN1	YGL173C	4587 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	STP1	YDR463W	1560 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	KTR6	YPL053C	1341 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	YPR148C	YPR148C	1308 nt		2.65	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	CDC26	YFR036W	375 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	MRPS35	YGR165W	1038 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	MRPL16	YBL038W	699 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	MDJ2	YNL328C	441 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	HSH49	YOR319W	642 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	RPS11B	YBR048W	471 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	snR34	snR34	203 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	REC8	YPR007C	2043 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	RRM3	YHR031C	2172 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	YLR446W	YLR446W	1302 nt		2.64	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	MAK21	YDR060W	3078 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	FAR1	YJL157C	2493 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	CUE3	YGL110C	1875 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	TMA108	YIL137C	2841 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	RCY1	YJL204C	2523 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	FAP7	YDL166C	594 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	PSF1	YDR013W	627 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	PDS1	YDR113C	1122 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	YGL118C	YGL118C	438 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	YKL091C	YKL091C	933 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	YAL069W	YAL069W	315 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	REX3	YLR107W	1215 nt		2.63	□□□□□ -1.99
VMA11	P32842	YMR316C-A	YMR316C-A	312 nt		2.63	□□□□□ -1.99

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