Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC13P31276 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms