Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPOP30536 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPOP30536 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPOP30536 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPOP30536 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPOP30536 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPOP30536 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPOP30536 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPOP30536 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSPOP30536 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSPOP30536 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSPOP30536 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TSPOP30536 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSPOP30536 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSPOP30536 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TSPOP30536 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSPOP30536 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSPOP30536 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSPOP30536 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSPOP30536 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSPOP30536 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSPOP30536 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSPOP30536 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSPOP30536 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSPOP30536 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSPOP30536 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSPOP30536 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSPOP30536 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSPOP30536 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TSPOP30536 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSPOP30536 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSPOP30536 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSPOP30536 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSPOP30536 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSPOP30536 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSPOP30536 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSPOP30536 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TSPOP30536 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TSPOP30536 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSPOP30536 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TSPOP30536 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSPOP30536 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSPOP30536 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSPOP30536 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSPOP30536 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSPOP30536 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSPOP30536 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSPOP30536 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSPOP30536 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSPOP30536 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSPOP30536 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSPOP30536 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSPOP30536 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSPOP30536 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSPOP30536 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSPOP30536 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSPOP30536 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSPOP30536 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSPOP30536 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSPOP30536 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSPOP30536 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TSPOP30536 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TSPOP30536 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSPOP30536 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSPOP30536 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSPOP30536 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSPOP30536 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSPOP30536 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TSPOP30536 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TSPOP30536 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TSPOP30536 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSPOP30536 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSPOP30536 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSPOP30536 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSPOP30536 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSPOP30536 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSPOP30536 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSPOP30536 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSPOP30536 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TSPOP30536 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSPOP30536 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSPOP30536 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSPOP30536 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSPOP30536 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSPOP30536 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSPOP30536 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSPOP30536 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSPOP30536 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSPOP30536 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSPOP30536 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSPOP30536 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSPOP30536 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSPOP30536 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSPOP30536 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSPOP30536 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSPOP30536 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSPOP30536 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TSPOP30536 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSPOP30536 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms