Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-FP30511 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-FP30511 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms