Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TM4SF1P30408 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TM4SF1P30408 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms