Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK1P29120 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCSK1P29120 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms