Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PEX2P28328 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PEX2P28328 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PEX2P28328 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PEX2P28328 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PEX2P28328 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PEX2P28328 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PEX2P28328 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PEX2P28328 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PEX2P28328 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PEX2P28328 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PEX2P28328 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PEX2P28328 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PEX2P28328 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PEX2P28328 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PEX2P28328 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PEX2P28328 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PEX2P28328 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PEX2P28328 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PEX2P28328 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PEX2P28328 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PEX2P28328 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PEX2P28328 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PEX2P28328 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PEX2P28328 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PEX2P28328 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PEX2P28328 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX2P28328 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX2P28328 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX2P28328 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX2P28328 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX2P28328 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX2P28328 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX2P28328 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX2P28328 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX2P28328 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX2P28328 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX2P28328 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX2P28328 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX2P28328 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX2P28328 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX2P28328 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX2P28328 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX2P28328 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX2P28328 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX2P28328 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PEX2P28328 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX2P28328 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX2P28328 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX2P28328 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX2P28328 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX2P28328 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX2P28328 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX2P28328 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX2P28328 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX2P28328 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX2P28328 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX2P28328 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX2P28328 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX2P28328 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX2P28328 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX2P28328 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PEX2P28328 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEX2P28328 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEX2P28328 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEX2P28328 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEX2P28328 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEX2P28328 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEX2P28328 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEX2P28328 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEX2P28328 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEX2P28328 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEX2P28328 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEX2P28328 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEX2P28328 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEX2P28328 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PEX2P28328 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PEX2P28328 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PEX2P28328 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PEX2P28328 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PEX2P28328 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PEX2P28328 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PEX2P28328 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PEX2P28328 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PEX2P28328 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PEX2P28328 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PEX2P28328 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PEX2P28328 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PEX2P28328 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PEX2P28328 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PEX2P28328 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PEX2P28328 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PEX2P28328 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PEX2P28328 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PEX2P28328 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PEX2P28328 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PEX2P28328 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PEX2P28328 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PEX2P28328 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PEX2P28328 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms