Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MCM3P25205 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCM3P25205 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCM3P25205 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCM3P25205 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCM3P25205 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCM3P25205 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MCM3P25205 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MCM3P25205 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MCM3P25205 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCM3P25205 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCM3P25205 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCM3P25205 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCM3P25205 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCM3P25205 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MCM3P25205 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCM3P25205 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCM3P25205 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCM3P25205 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCM3P25205 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCM3P25205 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCM3P25205 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCM3P25205 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCM3P25205 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MCM3P25205 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCM3P25205 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCM3P25205 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCM3P25205 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCM3P25205 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCM3P25205 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCM3P25205 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCM3P25205 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCM3P25205 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM3P25205 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM3P25205 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM3P25205 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM3P25205 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM3P25205 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM3P25205 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM3P25205 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM3P25205 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM3P25205 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM3P25205 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM3P25205 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCM3P25205 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM3P25205 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM3P25205 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM3P25205 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM3P25205 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM3P25205 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM3P25205 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM3P25205 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM3P25205 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM3P25205 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM3P25205 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM3P25205 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM3P25205 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM3P25205 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM3P25205 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM3P25205 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM3P25205 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCM3P25205 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM3P25205 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM3P25205 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM3P25205 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM3P25205 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM3P25205 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM3P25205 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM3P25205 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM3P25205 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM3P25205 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM3P25205 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM3P25205 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM3P25205 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCM3P25205 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM3P25205 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM3P25205 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM3P25205 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM3P25205 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM3P25205 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM3P25205 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM3P25205 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM3P25205 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM3P25205 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM3P25205 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM3P25205 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM3P25205 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM3P25205 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM3P25205 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM3P25205 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM3P25205 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM3P25205 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCM3P25205 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM3P25205 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM3P25205 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM3P25205 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM3P25205 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM3P25205 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM3P25205 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCM3P25205 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms