Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP4AP20648 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms