Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms