Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A1P19634 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A1P19634 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms