Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VCAM1P19320 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VCAM1P19320 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms