Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDCP19113 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDCP19113 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDCP19113 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDCP19113 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDCP19113 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDCP19113 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDCP19113 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDCP19113 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDCP19113 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDCP19113 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDCP19113 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDCP19113 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDCP19113 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDCP19113 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDCP19113 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDCP19113 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDCP19113 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HDCP19113 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDCP19113 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDCP19113 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDCP19113 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDCP19113 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDCP19113 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDCP19113 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDCP19113 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HDCP19113 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDCP19113 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDCP19113 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDCP19113 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDCP19113 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDCP19113 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDCP19113 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDCP19113 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDCP19113 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDCP19113 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDCP19113 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDCP19113 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDCP19113 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDCP19113 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDCP19113 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDCP19113 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDCP19113 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDCP19113 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDCP19113 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDCP19113 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HDCP19113 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDCP19113 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDCP19113 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDCP19113 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDCP19113 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDCP19113 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDCP19113 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDCP19113 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDCP19113 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDCP19113 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDCP19113 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HDCP19113 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDCP19113 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDCP19113 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDCP19113 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDCP19113 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HDCP19113 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HDCP19113 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDCP19113 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDCP19113 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDCP19113 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDCP19113 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDCP19113 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDCP19113 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HDCP19113 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDCP19113 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDCP19113 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDCP19113 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDCP19113 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDCP19113 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDCP19113 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDCP19113 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDCP19113 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDCP19113 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDCP19113 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDCP19113 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDCP19113 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HDCP19113 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDCP19113 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDCP19113 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDCP19113 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDCP19113 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDCP19113 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDCP19113 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDCP19113 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HDCP19113 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDCP19113 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDCP19113 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDCP19113 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDCP19113 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDCP19113 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDCP19113 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDCP19113 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDCP19113 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms