Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGB4P16144 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGB4P16144 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGB4P16144 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms