Protein–RNA interactions for Protein: P11487

FGF3, Fibroblast growth factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF3P11487 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FGF3P11487 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FGF3P11487 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FGF3P11487 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGF3P11487 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGF3P11487 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGF3P11487 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGF3P11487 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FGF3P11487 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGF3P11487 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGF3P11487 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGF3P11487 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGF3P11487 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGF3P11487 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGF3P11487 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGF3P11487 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGF3P11487 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGF3P11487 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGF3P11487 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGF3P11487 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGF3P11487 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FGF3P11487 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FGF3P11487 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGF3P11487 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGF3P11487 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGF3P11487 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGF3P11487 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGF3P11487 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FGF3P11487 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGF3P11487 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGF3P11487 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGF3P11487 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGF3P11487 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGF3P11487 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGF3P11487 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FGF3P11487 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGF3P11487 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGF3P11487 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGF3P11487 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGF3P11487 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGF3P11487 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGF3P11487 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGF3P11487 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGF3P11487 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGF3P11487 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGF3P11487 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGF3P11487 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGF3P11487 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGF3P11487 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGF3P11487 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGF3P11487 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGF3P11487 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGF3P11487 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGF3P11487 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGF3P11487 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGF3P11487 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGF3P11487 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGF3P11487 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGF3P11487 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGF3P11487 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGF3P11487 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGF3P11487 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGF3P11487 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGF3P11487 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGF3P11487 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGF3P11487 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGF3P11487 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGF3P11487 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGF3P11487 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGF3P11487 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGF3P11487 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGF3P11487 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGF3P11487 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGF3P11487 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGF3P11487 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGF3P11487 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGF3P11487 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGF3P11487 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGF3P11487 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGF3P11487 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FGF3P11487 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FGF3P11487 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGF3P11487 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGF3P11487 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGF3P11487 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGF3P11487 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FGF3P11487 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGF3P11487 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGF3P11487 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGF3P11487 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGF3P11487 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGF3P11487 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGF3P11487 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGF3P11487 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGF3P11487 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGF3P11487 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FGF3P11487 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGF3P11487 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGF3P11487 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGF3P11487 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms