Protein–RNA interactions for Protein: P11274

BCR, Breakpoint cluster region protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCRP11274 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCRP11274 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCRP11274 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCRP11274 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCRP11274 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCRP11274 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCRP11274 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCRP11274 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCRP11274 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCRP11274 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCRP11274 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BCRP11274 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCRP11274 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCRP11274 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCRP11274 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCRP11274 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCRP11274 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCRP11274 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BCRP11274 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCRP11274 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCRP11274 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCRP11274 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCRP11274 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BCRP11274 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCRP11274 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCRP11274 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCRP11274 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCRP11274 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BCRP11274 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BCRP11274 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCRP11274 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCRP11274 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCRP11274 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCRP11274 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCRP11274 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCRP11274 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCRP11274 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCRP11274 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCRP11274 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCRP11274 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCRP11274 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCRP11274 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCRP11274 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCRP11274 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCRP11274 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCRP11274 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCRP11274 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCRP11274 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCRP11274 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCRP11274 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCRP11274 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCRP11274 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCRP11274 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCRP11274 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCRP11274 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCRP11274 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCRP11274 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCRP11274 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCRP11274 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCRP11274 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCRP11274 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCRP11274 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCRP11274 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCRP11274 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCRP11274 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCRP11274 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCRP11274 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BCRP11274 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCRP11274 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCRP11274 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCRP11274 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCRP11274 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BCRP11274 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCRP11274 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCRP11274 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCRP11274 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCRP11274 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BCRP11274 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCRP11274 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCRP11274 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCRP11274 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCRP11274 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCRP11274 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCRP11274 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCRP11274 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCRP11274 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCRP11274 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCRP11274 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCRP11274 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCRP11274 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCRP11274 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BCRP11274 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCRP11274 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCRP11274 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCRP11274 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCRP11274 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCRP11274 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCRP11274 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCRP11274 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCRP11274 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms